Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem54Q9D7S1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem54Q9D7S1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms