Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl40Q9D783 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms