Protein–RNA interactions for Protein: Q9D711

Pir, Pirin, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PirQ9D711 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PirQ9D711 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PirQ9D711 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PirQ9D711 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PirQ9D711 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PirQ9D711 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PirQ9D711 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PirQ9D711 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PirQ9D711 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PirQ9D711 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PirQ9D711 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PirQ9D711 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PirQ9D711 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PirQ9D711 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PirQ9D711 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms