Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MsraQ9D6Y7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MsraQ9D6Y7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MsraQ9D6Y7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.9 ms