Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc105Q9D4K7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc105Q9D4K7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc105Q9D4K7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc105Q9D4K7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms