Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931423N10RikQ9D4J9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms