Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SarnpQ9D1J3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SarnpQ9D1J3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms