Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tspan11Q9D1D1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tspan11Q9D1D1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tspan11Q9D1D1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms