Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zcchc8Q9CYA6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zcchc8Q9CYA6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc8Q9CYA6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc8Q9CYA6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc8Q9CYA6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc8Q9CYA6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc8Q9CYA6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc8Q9CYA6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc8Q9CYA6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zcchc8Q9CYA6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms