Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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Lrrc17Q9CXD9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc17Q9CXD9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc17Q9CXD9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc17Q9CXD9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc17Q9CXD9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc17Q9CXD9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Lrrc17Q9CXD9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Lrrc17Q9CXD9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc17Q9CXD9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Lrrc17Q9CXD9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Lrrc17Q9CXD9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Lrrc17Q9CXD9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Lrrc17Q9CXD9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc17Q9CXD9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Lrrc17Q9CXD9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Lrrc17Q9CXD9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Lrrc17Q9CXD9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc17Q9CXD9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Lrrc17Q9CXD9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Lrrc17Q9CXD9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Lrrc17Q9CXD9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc17Q9CXD9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc17Q9CXD9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Lrrc17Q9CXD9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc17Q9CXD9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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Lrrc17Q9CXD9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc17Q9CXD9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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