Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dis3Q9CSH3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dis3Q9CSH3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dis3Q9CSH3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dis3Q9CSH3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dis3Q9CSH3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dis3Q9CSH3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dis3Q9CSH3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dis3Q9CSH3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dis3Q9CSH3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dis3Q9CSH3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dis3Q9CSH3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dis3Q9CSH3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dis3Q9CSH3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.9 ms