Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc96Q9CR92 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc96Q9CR92 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc96Q9CR92 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms