Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trappc2Q9CQP2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc2Q9CQP2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms