Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms