Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trim12aQ99PQ1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim12aQ99PQ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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