Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GpnmbQ99P91 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GpnmbQ99P91 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms