Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tsnaxip1Q99P25 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tsnaxip1Q99P25 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tsnaxip1Q99P25 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms