Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcgf6Q99NA9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Pcgf6Q99NA9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms