Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm2d1Q99MB3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d1Q99MB3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms