Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cmtm3Q99LJ5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmtm3Q99LJ5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm3Q99LJ5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms