Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf34Q99KR6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf34Q99KR6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf34Q99KR6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf34Q99KR6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms