Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nlgn1Q99K10 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nlgn1Q99K10 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nlgn1Q99K10 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nlgn1Q99K10 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms