Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sdcbp2Q99JZ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sdcbp2Q99JZ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sdcbp2Q99JZ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms