Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mcoln1Q99J21 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mcoln1Q99J21 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcoln1Q99J21 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms