Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Xrcc4Q924T3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Xrcc4Q924T3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Xrcc4Q924T3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xrcc4Q924T3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Xrcc4Q924T3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xrcc4Q924T3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xrcc4Q924T3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xrcc4Q924T3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xrcc4Q924T3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc4Q924T3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc4Q924T3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc4Q924T3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc4Q924T3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms