Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spdl1Q923A2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Spdl1Q923A2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms