Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf3Q922U1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf3Q922U1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf3Q922U1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms