Protein–RNA interactions for Protein: Q920R6

Atp6v0a4, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 4, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0a4Q920R6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v0a4Q920R6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v0a4Q920R6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v0a4Q920R6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v0a4Q920R6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v0a4Q920R6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v0a4Q920R6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v0a4Q920R6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v0a4Q920R6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v0a4Q920R6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v0a4Q920R6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v0a4Q920R6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v0a4Q920R6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6v0a4Q920R6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v0a4Q920R6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms