Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nek8Q91ZR4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek8Q91ZR4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek8Q91ZR4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms