Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cts3Q91ZD5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cts3Q91ZD5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cts3Q91ZD5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cts3Q91ZD5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cts3Q91ZD5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms