Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp1bQ91YK2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp1bQ91YK2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rrp1bQ91YK2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms