Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha7Q91Y13 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha7Q91Y13 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha7Q91Y13 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms