Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cabp4Q8VHC5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cabp4Q8VHC5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cabp4Q8VHC5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms