Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Cep57l1Q8VDS7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep57l1Q8VDS7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep57l1Q8VDS7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms