Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpap2Q8VC34 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpap2Q8VC34 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpap2Q8VC34 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms