Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg10Q8R1P4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg10Q8R1P4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg10Q8R1P4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms