Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc137Q8R0K4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc137Q8R0K4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc137Q8R0K4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms