Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sf3b4Q8QZY9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b4Q8QZY9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms