Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pof1bQ8K4L4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pof1bQ8K4L4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms