Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brd3Q8K2F0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd3Q8K2F0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd3Q8K2F0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms