Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spire2Q8K1S6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spire2Q8K1S6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spire2Q8K1S6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Spire2Q8K1S6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms