Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sde2Q8K1J5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sde2Q8K1J5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sde2Q8K1J5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sde2Q8K1J5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms