Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H7

Slc45a3, Solute carrier family 45 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a3Q8K0H7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc45a3Q8K0H7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Slc45a3Q8K0H7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc45a3Q8K0H7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms