Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tbc1d23Q8K0F1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbc1d23Q8K0F1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbc1d23Q8K0F1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms