Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc5a11Q8K0E3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc5a11Q8K0E3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms