Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sh2d5Q8JZW5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh2d5Q8JZW5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh2d5Q8JZW5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms