Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Card11Q8CIS0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Card11Q8CIS0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Card11Q8CIS0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Card11Q8CIS0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
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