Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lancl3Q8CD19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lancl3Q8CD19 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lancl3Q8CD19 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms