Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
E4f1Q8CCE9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E4f1Q8CCE9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
E4f1Q8CCE9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms