Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Spef2Q8C9J3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Spef2Q8C9J3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Spef2Q8C9J3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Spef2Q8C9J3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms